More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5793 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  100 
 
 		 346 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  74.78 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  72.83 
 
 		 346 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  69.79 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  66.76 
 
 		 346 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  67.06 
 
 		 344 aa  484  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.81 
 
 		 364 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  38.72 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  37.02 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  37.46 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  39 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  36.34 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  34.92 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  34.92 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  34.92 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  37.67 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  35.93 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  37.78 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  34.64 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  34.64 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  39.72 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  37.12 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  40.34 
 
 		 350 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  36.34 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  39.78 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  39.55 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  40.44 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  40.44 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  40.44 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  38.18 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  37.85 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  37.74 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  36.54 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  36.54 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 382 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  38.9 
 
 		 371 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  34.54 
 
 		 366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  38.19 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  37.61 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  38.55 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  37.61 
 
 		 353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  38.29 
 
 		 389 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  37.01 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  36.87 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  34.63 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  36.99 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  39.06 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  35.62 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  36.84 
 
 		 360 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  34.1 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  37.78 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  40.5 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  38.61 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  37.82 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  37.26 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  36.86 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  34.83 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  36.29 
 
 		 361 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  35.38 
 
 		 365 aa  205  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  39.34 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  34.78 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  35.69 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  38.06 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  36.74 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  35.98 
 
 		 383 aa  202  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  36.94 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  34.93 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  35.97 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  35.54 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  37.99 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  37.43 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.73 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  38.25 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  36.77 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  35.69 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  34.42 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  33.06 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  37.08 
 
 		 358 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  34.2 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  35.85 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  34.43 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  33.71 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  37.1 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  34.76 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>