More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12996 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 
373 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  80.16 
 
 
371 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  80.16 
 
 
371 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  81.04 
 
 
367 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  80.16 
 
 
371 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  80.22 
 
 
367 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  61.75 
 
 
365 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  63.93 
 
 
362 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  57.92 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  57.1 
 
 
368 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  61.99 
 
 
367 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  58.68 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  53.93 
 
 
383 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  57.03 
 
 
384 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  55.98 
 
 
367 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  51.92 
 
 
394 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  51.36 
 
 
364 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  53.14 
 
 
377 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  51.96 
 
 
373 aa  346  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  53.6 
 
 
376 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  52.13 
 
 
369 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  53.62 
 
 
371 aa  342  7e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  52.94 
 
 
372 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  52.02 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  50.81 
 
 
389 aa  338  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  49.87 
 
 
376 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  53.78 
 
 
389 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  49.73 
 
 
386 aa  322  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  51.1 
 
 
350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  50 
 
 
382 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  50.8 
 
 
374 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  50.94 
 
 
382 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  48.51 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  44.93 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  46.01 
 
 
367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  47.37 
 
 
379 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  43.86 
 
 
376 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  44.38 
 
 
366 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  43.92 
 
 
380 aa  292  7e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  45.99 
 
 
364 aa  291  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.99 
 
 
366 aa  289  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 
364 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 
364 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 
364 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  44.28 
 
 
395 aa  286  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.72 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  43.99 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  44.14 
 
 
367 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  43.94 
 
 
367 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 
376 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  46.01 
 
 
371 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  42.05 
 
 
393 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  40.7 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  42.55 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.51 
 
 
359 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  42.74 
 
 
343 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  44.92 
 
 
370 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  40.76 
 
 
364 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  40.71 
 
 
364 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  43.53 
 
 
357 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  41.48 
 
 
375 aa  268  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  39.78 
 
 
365 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  44.04 
 
 
383 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 
353 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  43.24 
 
 
371 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  40.58 
 
 
366 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  42.34 
 
 
363 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  41.78 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  38.13 
 
 
357 aa  258  9e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  39.45 
 
 
361 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  40.32 
 
 
351 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  39.78 
 
 
362 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  40.38 
 
 
360 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  44.59 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  41.37 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  40.05 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  43.63 
 
 
382 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  46.99 
 
 
351 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  38.07 
 
 
353 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.54 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  41.87 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 
361 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 
361 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  39.18 
 
 
361 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  37.74 
 
 
362 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 
353 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  38.9 
 
 
361 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  40.33 
 
 
366 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  39.47 
 
 
351 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>