More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2535 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  99.45 
 
 
364 aa  752    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 
364 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  42.93 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  40.92 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.55 
 
 
370 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  40.56 
 
 
361 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
364 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  40.27 
 
 
366 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
364 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  41.11 
 
 
373 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 
364 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  39.2 
 
 
376 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.32 
 
 
359 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  40.55 
 
 
366 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  40.31 
 
 
376 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  40.76 
 
 
364 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  40.52 
 
 
383 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  41.26 
 
 
361 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  39.29 
 
 
366 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  37.15 
 
 
393 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  41.14 
 
 
362 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  40.27 
 
 
372 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  40.43 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  39.84 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  40.44 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  40.32 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 
365 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 
361 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 
361 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  39.57 
 
 
377 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 
382 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  42.33 
 
 
361 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  41.44 
 
 
351 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  39.51 
 
 
362 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 
368 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 
364 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  39.3 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.7 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  42.27 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  39.34 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  40.92 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  38.75 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  38.75 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  38.75 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  39.19 
 
 
367 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  38.8 
 
 
364 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  38.87 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 
367 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  39.34 
 
 
376 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 
369 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  41.74 
 
 
352 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  39.01 
 
 
400 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  40.4 
 
 
350 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  40.43 
 
 
369 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  40.27 
 
 
362 aa  249  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  38.21 
 
 
365 aa  248  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 
376 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 
351 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  35.87 
 
 
360 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  40.44 
 
 
362 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.46 
 
 
366 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  39.71 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  37.77 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  39.55 
 
 
343 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  39.55 
 
 
357 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  37.6 
 
 
375 aa  241  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  38.1 
 
 
358 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.72 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  35.91 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  40.78 
 
 
386 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  38.23 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  35.9 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  37.7 
 
 
360 aa  238  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  36.36 
 
 
384 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  38.33 
 
 
362 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  38.06 
 
 
355 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  38.4 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  36.01 
 
 
363 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  38.36 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  38.86 
 
 
339 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  38.98 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  35.62 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  37.18 
 
 
357 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 
356 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1308  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 
378 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 
356 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  36.29 
 
 
348 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 
351 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>