More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1414 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 
346 aa  706    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  79.88 
 
 
348 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  72.83 
 
 
346 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  74.19 
 
 
341 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  68.79 
 
 
346 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  68.51 
 
 
344 aa  481  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  39.94 
 
 
364 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.62 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  39.28 
 
 
367 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  249  6e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 
364 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  38.94 
 
 
366 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  39.09 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  37.92 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  37.92 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  37.92 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  40.39 
 
 
369 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  37.18 
 
 
366 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  37.36 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  37.36 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  37.92 
 
 
366 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  39.14 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  37.81 
 
 
376 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  37.64 
 
 
375 aa  229  4e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 
360 aa  228  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.46 
 
 
367 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  39.78 
 
 
363 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 
363 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  41.16 
 
 
360 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  40.27 
 
 
383 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  36.8 
 
 
365 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  38.5 
 
 
357 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  39.55 
 
 
368 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 
371 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 
371 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  40.88 
 
 
382 aa  222  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  38.95 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  37.74 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  40.56 
 
 
360 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  38.46 
 
 
360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  37.98 
 
 
360 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 
400 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  39.84 
 
 
382 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 
373 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  41.27 
 
 
367 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  38.35 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  36.36 
 
 
366 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  38.19 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  36.36 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  37.37 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  38.04 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  37.01 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  38.54 
 
 
394 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  37.54 
 
 
355 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  39.83 
 
 
362 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 
361 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  41.64 
 
 
384 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  34.27 
 
 
364 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  39.01 
 
 
389 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  38.29 
 
 
389 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  35.9 
 
 
395 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  35.46 
 
 
367 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  37.63 
 
 
371 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  38.5 
 
 
350 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 
376 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  36.78 
 
 
367 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  38.38 
 
 
372 aa  206  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  34.08 
 
 
361 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  34.08 
 
 
361 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  34.08 
 
 
361 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  37.16 
 
 
370 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  37.12 
 
 
365 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  34.37 
 
 
361 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  34.37 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  34.44 
 
 
375 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  38.68 
 
 
358 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  37.33 
 
 
380 aa  203  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  37.78 
 
 
386 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  33.89 
 
 
362 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  35.59 
 
 
353 aa  202  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 
343 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  33.62 
 
 
361 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  33.62 
 
 
361 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  34.17 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  37.37 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  38.86 
 
 
376 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  34.99 
 
 
352 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  34.86 
 
 
366 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  37.74 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  37.12 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  33.06 
 
 
368 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>