More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1271 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 353 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  99.15 
 
 		 366 aa  712    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  66.67 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  66.57 
 
 		 358 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  43.89 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  43.89 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  43.89 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  44.41 
 
 		 364 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  44.41 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  44.41 
 
 		 367 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  45.1 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  42.02 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.74 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  42.02 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  43.66 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  43.7 
 
 		 363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.39 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  40.39 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  42.42 
 
 		 376 aa  271  9e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  41.99 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.5 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  40.71 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.5 
 
 		 355 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  41.67 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 364 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  39.32 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  39.83 
 
 		 360 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  38.81 
 
 		 376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  40.33 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  41.83 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  38.57 
 
 		 365 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  40.66 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  40.66 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  40.66 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  39.24 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  40.38 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  40.5 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  40.5 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  39.34 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.34 
 
 		 367 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  39.56 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1308  D-alanyl-alanine synthetase A  44.76 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.04 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  39.04 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  38.5 
 
 		 365 aa  248  8e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  39.04 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  39.11 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  41.24 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  38.76 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.76 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  39.11 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  39.61 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  37.7 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  38.2 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  39.09 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  37.36 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  39.39 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  38.11 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  37.25 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  37.25 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.5 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  37.29 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  40.49 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  38.5 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  36.59 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  39.67 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  38.83 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.5 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  40.93 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  36.97 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 400 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  38.95 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  36.61 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  36.84 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  36.74 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  37.85 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4346  D-alanine--D-alanine ligase A  39.03 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  36.39 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0192  D-alanine/D-alanine ligase  38.36 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1521  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  35.83 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  36.11 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  38.98 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  37.23 
 
 		 351 aa  226  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  37.98 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  34.1 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>