More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0905 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 360 aa  741    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  65.46 
 
 		 360 aa  498  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  59.27 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  59.55 
 
 		 363 aa  431  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  57.98 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  50.28 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  51.81 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  43.39 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  43.82 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  45.9 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  44.08 
 
 		 376 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  44.94 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  43.21 
 
 		 370 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  42.01 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.41 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  42.86 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  41.24 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  43.33 
 
 		 359 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  45.1 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  41.87 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  41.85 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  42.82 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  40.85 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  42.08 
 
 		 364 aa  279  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  43.82 
 
 		 339 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  42.78 
 
 		 367 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  42.11 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.9 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  40.34 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  43.26 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  41.64 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 363 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  41.18 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  40.11 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  39.61 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.61 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  39.61 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  39.94 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.33 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  39.04 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  39.25 
 
 		 351 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.04 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  43.42 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  42.82 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  38.76 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  38.76 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  40.11 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  43.67 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  38.06 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  41.62 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  43.4 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  43.4 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  39.29 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  39.23 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  39.41 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  41.96 
 
 		 373 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.46 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  41.73 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  37.88 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  42.01 
 
 		 376 aa  248  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  41.05 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  39.28 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  40.34 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  39.01 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  40.11 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  39.39 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  40.89 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  39.62 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  40.48 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  40.17 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  41.73 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  41.85 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  39.54 
 
 		 380 aa  242  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  41.6 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  42.7 
 
 		 324 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  41.34 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>