More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1529 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 363 aa  739    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  62.6 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  62.64 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  59.55 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  60.28 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  54.34 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  52.5 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  43.01 
 
 		 361 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  43.36 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  46.93 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  43.25 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  44.5 
 
 		 376 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  44.78 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  43.68 
 
 		 351 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  40.11 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  40.98 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  40.71 
 
 		 351 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.58 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  41.99 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  44.02 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  41.76 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  40.55 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  43.49 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  42.62 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  44.29 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  43.55 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  39.01 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  38.74 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  41.89 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 367 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  42.19 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  41.39 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  40.44 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  41.39 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  41.8 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.8 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  39.66 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  38.74 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  41.62 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  41.74 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  41.82 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 363 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  38.61 
 
 		 361 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  42.34 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  40.93 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  41.73 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  39 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  41.53 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  39.72 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  43.33 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  41.37 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  39.8 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  42.16 
 
 		 382 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  40.42 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  39.01 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  39.35 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  40.49 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  40.22 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  39.83 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  39.56 
 
 		 379 aa  246  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  40.51 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  40.21 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  40.82 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  40.16 
 
 		 382 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  39.57 
 
 		 389 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  40.16 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  41.27 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  38.71 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  37.64 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  36.87 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  39.61 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  38.54 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  39.19 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  38.08 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  40.33 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 		 368 aa  236  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  40.67 
 
 		 383 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>