More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0416 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  99.45 
 
 		 364 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 364 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  99.18 
 
 		 364 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 364 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 364 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  89.56 
 
 		 364 aa  680    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  89.84 
 
 		 364 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  82.14 
 
 		 366 aa  620  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  69.23 
 
 		 366 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  69.23 
 
 		 366 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  70.6 
 
 		 367 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  64.01 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  64.04 
 
 		 375 aa  478  1e-133  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  62.6 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  58.56 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  58.22 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  46.32 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  44.09 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  45.8 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  42.98 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  44.02 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  43.2 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  43.35 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  43.21 
 
 		 365 aa  312  6.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  44.03 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  45.33 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  43.2 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  44.29 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  42.02 
 
 		 359 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  43.2 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  43.89 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  43.28 
 
 		 361 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  43.42 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  43.42 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.28 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  43.89 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  43.28 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.08 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  44.32 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  45.53 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  42.39 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  44.26 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  45.19 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  45.48 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  42.39 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  44.2 
 
 		 367 aa  298  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  43.37 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  43.92 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  44.66 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  41.87 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  44.69 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  43.63 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  44.69 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  44.69 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  41.9 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 378 aa  291  8e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  43.78 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  43.65 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  42.37 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  46.02 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.27 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  45.68 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  43.62 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  42.9 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  43.32 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  41.71 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  42.42 
 
 		 379 aa  285  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  41.85 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  41.32 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  41.96 
 
 		 351 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  44.82 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  44.16 
 
 		 382 aa  279  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  41 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  41.96 
 
 		 373 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  42.98 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  42.4 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  41.23 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  42.22 
 
 		 386 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  41.07 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  42.78 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  42.5 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  40.34 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  42.58 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  40.88 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  41.55 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>