More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2385 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 368 aa  756    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  44.17 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  44.86 
 
 		 376 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  41.44 
 
 		 383 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  41.13 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  44.2 
 
 		 359 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  44.47 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  40.58 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  41.97 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  38.38 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  39.51 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  38.42 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.19 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  38.48 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  42.46 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  39.67 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 367 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  40.71 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  39.45 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  39.24 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  38.69 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  38.96 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  41.16 
 
 		 351 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  38.46 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  40.05 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  40.05 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  40.05 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  39.44 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  39.94 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  37.4 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  40.53 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  40.27 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  41.13 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  39.18 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  39.78 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  41.42 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  40.59 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  37.95 
 
 		 351 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  40.67 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  38.48 
 
 		 377 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  40.32 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  38.75 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  38.95 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  40.38 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  38.83 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  38.96 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  37.91 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  40.5 
 
 		 353 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  37.88 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  36.19 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  37.82 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0201  D-alanyl-alanine synthetase A  38.59 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  40.16 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  37.81 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  37.06 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  39.01 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  37.99 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  36.91 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  38.5 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 360 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  40.71 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  38.07 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  36.81 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  36.84 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  37.63 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  37.53 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  39.22 
 
 		 339 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.73 
 
 		 394 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  38.4 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  37.23 
 
 		 353 aa  235  9e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  38.33 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  35.92 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  37.13 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  38.44 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  37.85 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  37.3 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  37.3 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  37.3 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  36.69 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  39.83 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>