More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0201 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0201  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 
361 aa  726    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 
359 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  38.59 
 
 
368 aa  246  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  36.97 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  37.04 
 
 
376 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  36.77 
 
 
376 aa  232  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  38.32 
 
 
357 aa  230  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  35.56 
 
 
370 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  36.94 
 
 
356 aa  229  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  36.94 
 
 
356 aa  229  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  36.83 
 
 
371 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  35.38 
 
 
393 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  34.84 
 
 
362 aa  225  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 
351 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  37.43 
 
 
351 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  40.77 
 
 
364 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  37.16 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  35.93 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  37.06 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  36.31 
 
 
352 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  36.31 
 
 
362 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  35.29 
 
 
376 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  35.26 
 
 
361 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  37.12 
 
 
360 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  36.21 
 
 
348 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  34.5 
 
 
361 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  36.36 
 
 
360 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  34.5 
 
 
361 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  35.26 
 
 
361 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  35.26 
 
 
361 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  38.95 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  33.88 
 
 
367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  36.67 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  35.28 
 
 
366 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  37.43 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  34.96 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  39.37 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  33.15 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  35.28 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  33.15 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  34.93 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  34.44 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  35.71 
 
 
360 aa  212  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  35.64 
 
 
367 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  41.01 
 
 
355 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  39.34 
 
 
363 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  36.19 
 
 
382 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 
361 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  35.28 
 
 
367 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  40.06 
 
 
355 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  37.78 
 
 
353 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  33.78 
 
 
389 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 
366 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  36.12 
 
 
369 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 
349 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  33.42 
 
 
361 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  34.55 
 
 
366 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  34.41 
 
 
367 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  35.44 
 
 
358 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  35.8 
 
 
343 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  34.77 
 
 
350 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  35.58 
 
 
360 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  34.76 
 
 
339 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 
364 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 
364 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  35.39 
 
 
382 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  35.08 
 
 
364 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  35.08 
 
 
364 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  35.08 
 
 
364 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  35.05 
 
 
364 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  36.01 
 
 
363 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.24 
 
 
353 aa  205  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 
363 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  33.42 
 
 
377 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  33.9 
 
 
350 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  33.52 
 
 
360 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  34.97 
 
 
353 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  35.05 
 
 
367 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  35.43 
 
 
380 aa  203  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1308  D-alanyl-alanine synthetase A  36.13 
 
 
378 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  34.25 
 
 
369 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  34.93 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  34.58 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  35.47 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  33.51 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  33.97 
 
 
372 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  38.9 
 
 
355 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  32.96 
 
 
357 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>