More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2952 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 351 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  55.41 
 
 		 383 aa  398  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  53.63 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  50.68 
 
 		 370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  52.78 
 
 		 371 aa  359  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  52.22 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  51.41 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  49.16 
 
 		 367 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  48.6 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  52.29 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  50 
 
 		 351 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  51.7 
 
 		 351 aa  341  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  47.84 
 
 		 366 aa  339  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  49.58 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  49.44 
 
 		 359 aa  338  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  47.21 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  53.78 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  46.89 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  47.18 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  46.89 
 
 		 361 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  47.18 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  47.18 
 
 		 361 aa  336  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  47.18 
 
 		 361 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  46.89 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  45.92 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  48.32 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  45.63 
 
 		 376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  47.27 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  48.39 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  45.63 
 
 		 365 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  43.91 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  51.29 
 
 		 349 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  41.83 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  41.83 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  52.09 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  41.26 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  50.28 
 
 		 369 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  48.48 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  49.43 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  47.38 
 
 		 377 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  49.58 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  46.51 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  46.05 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  47.65 
 
 		 376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  44.66 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  46.82 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  47.79 
 
 		 373 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  45.96 
 
 		 377 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.38 
 
 		 364 aa  285  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.78 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  43.39 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  47.79 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  41.16 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  46.85 
 
 		 371 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  42.19 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.92 
 
 		 364 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  46.55 
 
 		 350 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  41.94 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  46.96 
 
 		 382 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  41.62 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.62 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.61 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  42.44 
 
 		 348 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  42.06 
 
 		 367 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  42.73 
 
 		 348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  47.12 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  44.36 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  45.68 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  43.39 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  46.13 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  41.46 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  41.41 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  44.04 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  46.59 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  46.51 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  43.92 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  46.87 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  46.87 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  46.06 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  47.14 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  47.28 
 
 		 367 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  45.88 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  44.68 
 
 		 389 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.04 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  46.94 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  40.23 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  46.9 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  46.81 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  38.15 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>