More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2856 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 362 aa  731    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  61.96 
 
 		 370 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  59.41 
 
 		 371 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  55.56 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  52.01 
 
 		 383 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  49.74 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  52.42 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  51.87 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  47.67 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  46.05 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  44.9 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  51.97 
 
 		 351 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  45.81 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  45.58 
 
 		 351 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  45.58 
 
 		 351 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  44.03 
 
 		 365 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  44.59 
 
 		 362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  45.75 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  45.85 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  48.31 
 
 		 350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  43.84 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.9 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  46.28 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  43.78 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 		 352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.78 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  43.78 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  43.24 
 
 		 361 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  43.24 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  43.41 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  42.97 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  42.43 
 
 		 362 aa  298  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  42.97 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  45.79 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  43.75 
 
 		 351 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  43.75 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  43.71 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  41.55 
 
 		 357 aa  285  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  44.35 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  43.06 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  42.27 
 
 		 368 aa  282  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  45.89 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  43.79 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  45.25 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  41.78 
 
 		 360 aa  278  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  42.31 
 
 		 353 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  275  6e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  46.69 
 
 		 347 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  45.14 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  47.01 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  42.42 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  42.15 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  42.15 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  42.15 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  44.6 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.02 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  46.03 
 
 		 371 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  46.03 
 
 		 371 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  41.46 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  46.03 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  44.88 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  43.82 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  44.74 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  40.11 
 
 		 360 aa  268  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  39.94 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  39.89 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  42.9 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  45.65 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 		 363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  41.87 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  43.31 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  43.9 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  43.44 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  40.93 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  43.02 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  45.03 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  43.44 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  44.51 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  41.88 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.35 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  41.41 
 
 		 375 aa  260  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  46.24 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 360 aa  259  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  45.79 
 
 		 371 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  42.51 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 		 376 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>