More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3791 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 353 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  52.33 
 
 		 376 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  49.86 
 
 		 364 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  50.96 
 
 		 376 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  47.28 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  45.07 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.97 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  45.74 
 
 		 361 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  44.92 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  44.01 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  45.25 
 
 		 362 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  42.74 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  42.54 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  43.61 
 
 		 362 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  41.55 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  43.26 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 		 362 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  43.41 
 
 		 377 aa  285  9e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  43.54 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  43.7 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  43.54 
 
 		 361 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  42.7 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  42.9 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  44.54 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  41.27 
 
 		 395 aa  279  5e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  40.34 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  40.66 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  42.46 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  40.21 
 
 		 367 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  43.87 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  43.87 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  41.95 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  41.01 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  41.83 
 
 		 351 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  42.11 
 
 		 352 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  40.93 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  41.9 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  39.95 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  41.87 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  40.38 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  42.01 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  41.37 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  42.31 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  41.44 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  39.72 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  41.85 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  41.58 
 
 		 382 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  41.31 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  41.43 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  41.85 
 
 		 368 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  41.97 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  41.08 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  41.4 
 
 		 376 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  39.34 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  41.32 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  40.81 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  38.08 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  40.17 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  40.17 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  39.38 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  40.55 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  39.15 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  41.64 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  41.57 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  38.87 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 367 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  41.01 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  43.39 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  41.69 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  38.23 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  39.43 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 		 371 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  40.33 
 
 		 371 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  40.4 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  39.83 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  39.38 
 
 		 361 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  41.8 
 
 		 371 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 368 aa  248  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  38.04 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  41.53 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  38.92 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  40.55 
 
 		 389 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>