More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2039 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 364 aa  739    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  52.2 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  50.69 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  52.66 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  49.86 
 
 		 353 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  46.55 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  46.92 
 
 		 370 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  49.16 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  46.4 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  50 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.26 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  47.55 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  43.21 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  46.39 
 
 		 362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  45.88 
 
 		 361 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  44.9 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  45.9 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  46.15 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  43.28 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  44.2 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  44.57 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  43.68 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  45.28 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  46.48 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  43.41 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  43.41 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  41.3 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  43.41 
 
 		 361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  43.13 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.13 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  43.13 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  43.29 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  44.35 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  44.1 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  42.39 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  43.91 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  42.62 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  43.53 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  43.53 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  46.93 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  40.21 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  43.33 
 
 		 357 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  40.58 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  43.65 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  41.03 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  40.21 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  43.16 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  43.37 
 
 		 351 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  41.48 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  42.55 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  43.8 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  42.93 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.47 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  40.05 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  43.8 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  40.16 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  40.87 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  40.76 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  41.39 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  41.62 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  41.76 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  41.27 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  41.11 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  38.42 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  40.92 
 
 		 373 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  42.54 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  41.57 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  41.27 
 
 		 351 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  40.6 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  40.06 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  41.29 
 
 		 371 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  40.91 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  40.44 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  39.53 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 		 382 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 		 395 aa  269  7e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  39.55 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  41.81 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  39.94 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>