More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14671 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 355 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  71.47 
 
 		 355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  71.75 
 
 		 355 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  69.77 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  45.98 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  46.26 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  44.86 
 
 		 353 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 353 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  42.2 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  40.4 
 
 		 350 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  43.63 
 
 		 351 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  43.06 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  41.34 
 
 		 367 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  43.55 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  42.49 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  40.4 
 
 		 351 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  39.95 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  38.98 
 
 		 383 aa  261  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  39.15 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  39.77 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  37.98 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  36.67 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  36.41 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  39.54 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  37.99 
 
 		 367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.59 
 
 		 370 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  38.24 
 
 		 361 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  37.61 
 
 		 365 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  38.53 
 
 		 361 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  38.53 
 
 		 361 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  38.24 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  37.96 
 
 		 362 aa  245  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.24 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  36.39 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  35.64 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  36.41 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  38.24 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  36.19 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  35 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  37.67 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  35.29 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  35.29 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  35.29 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  35.79 
 
 		 393 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  37.68 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  37.57 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  37.11 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  35.38 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  35.11 
 
 		 361 aa  235  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  36.52 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  35.01 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  35.01 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  38.29 
 
 		 348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  34.73 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  37.57 
 
 		 357 aa  232  6e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  35.18 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  33.8 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  36.31 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  33.89 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  36.71 
 
 		 361 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  35.98 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  36.94 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  35.18 
 
 		 363 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  35.26 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  36.46 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  36.81 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  35.47 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  35.47 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  32.18 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  32.18 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  32.18 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  34.92 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  34.64 
 
 		 360 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  35.07 
 
 		 373 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  35.18 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  34.73 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  32.62 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  33.8 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  34.5 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  32.79 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0201  D-alanyl-alanine synthetase A  41.01 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  31.62 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  31.32 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  32.68 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  32.77 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  35 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  31.38 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  31.08 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>