More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0337 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 322 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  74.38 
 
 		 324 aa  484  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  51.34 
 
 		 339 aa  299  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  46.72 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  46.31 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  46.31 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  46.31 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  47.13 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  45.74 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  46.26 
 
 		 351 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  45.74 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  45.3 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  46.55 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  45 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  45.87 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  43.31 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  42.98 
 
 		 351 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  45.89 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  44.6 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  42.69 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  43.59 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  43.59 
 
 		 366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  44.04 
 
 		 370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  45.82 
 
 		 358 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  43.06 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  42.69 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  42.42 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  42.61 
 
 		 362 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  42.12 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  42.19 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  42.17 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  44.83 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  42.9 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  44.61 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  42.41 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  42.36 
 
 		 361 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  41.88 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  39.3 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  39.3 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  41.88 
 
 		 361 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  41.6 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  41.64 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  46.36 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  41.53 
 
 		 375 aa  259  3e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  41.76 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  42.86 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  40.85 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  38.12 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.94 
 
 		 360 aa  255  6e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.19 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  43.24 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  40.72 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  41.91 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  41.25 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  41.93 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  38.95 
 
 		 376 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  40.68 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  43.71 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  38.86 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  38.62 
 
 		 348 aa  245  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  42.27 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  42.86 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  41.97 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  41.48 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  35.55 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  42.86 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  37.28 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  41.11 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  42.5 
 
 		 373 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  40.97 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  42.39 
 
 		 372 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  40.79 
 
 		 363 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  37.78 
 
 		 376 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  37.57 
 
 		 355 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  37.94 
 
 		 348 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  39.6 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  39.6 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  40.17 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  43.1 
 
 		 367 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  41.01 
 
 		 369 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  36.42 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 		 400 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  40.83 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  37.13 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  39.08 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  41.67 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  39.53 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  40.06 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>