More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0036 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 380 aa  782    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  35.92 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  35.92 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  36.73 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  35.48 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  34.43 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  35.71 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  35.05 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  37.8 
 
 		 376 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  37.43 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  34.97 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  35.15 
 
 		 361 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  35.31 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  32.88 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  33.15 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  36.12 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  33.69 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  34.64 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  34.35 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  36.63 
 
 		 373 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 		 367 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  35.18 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  35.31 
 
 		 365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  34.17 
 
 		 376 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  33.16 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  34.72 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  35.75 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  34.05 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  33.51 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  34.24 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  33.88 
 
 		 351 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  32.27 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  34.63 
 
 		 355 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  33.42 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  31.83 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  33.98 
 
 		 353 aa  209  9e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  32.27 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  36.26 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  34.5 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  34.38 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  32.28 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  31.73 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  34.13 
 
 		 371 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  31.73 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  33.88 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  31.47 
 
 		 361 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  36.14 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  31.73 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  31.73 
 
 		 361 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  32.72 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  31.47 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  35.97 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  33.61 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  32.51 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  32.79 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.51 
 
 		 351 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  33.42 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  32.41 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  34.25 
 
 		 353 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  30.93 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  30.56 
 
 		 377 aa  199  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  32.07 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  32.61 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  32.52 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  32.69 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  35.36 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  33.86 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  32.1 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  33.88 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  31.62 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  32.79 
 
 		 369 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  33.79 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  30.53 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  33.98 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  31.82 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  34.42 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  32.71 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  31.82 
 
 		 364 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  32.34 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  32 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  32.78 
 
 		 367 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  30.19 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  29.92 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  29.82 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  33.15 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  32.42 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  31.75 
 
 		 361 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0201  D-alanyl-alanine synthetase A  30.91 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  33.76 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>