More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0477 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 378 aa  773    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0264  D-alanyl-alanine synthetase A  52.66 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0672  D-alanyl-alanine synthetase A  48.4 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00380934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  40.5 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  40.06 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  40 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  41.96 
 
 		 375 aa  292  6e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  41.64 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  39.73 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  38.65 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  41.16 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  45.03 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  39.44 
 
 		 375 aa  272  8.000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  38 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  41.14 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  38.15 
 
 		 364 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  37.87 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  36.63 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  38.14 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  37.7 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  39.55 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  39.58 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  41.21 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  41.19 
 
 		 364 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  40.26 
 
 		 376 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  38.72 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  37.02 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  38.27 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  40.16 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  38.55 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  38.62 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  37.29 
 
 		 361 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  37.92 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  39.17 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  38.78 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  37.02 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  37.77 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  37.29 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  37.26 
 
 		 361 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  38.6 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  35.64 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  37.02 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  39.35 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  37.57 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  37.02 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  37.29 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  37.02 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  39.84 
 
 		 351 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  37.78 
 
 		 339 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  36.99 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  36.94 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  36.94 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  37.64 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  37.64 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  39.02 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  37.64 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  37.22 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  37.91 
 
 		 352 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  36.54 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  35.52 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  37.36 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  37.22 
 
 		 358 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  36.68 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  38.2 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1490  D-alanyl-alanine synthetase A  36.51 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  38.07 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  36.51 
 
 		 373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  38.15 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  35.54 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  34.78 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  36.94 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  35.62 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  38.25 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  35.23 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  37.74 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  34.49 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  35.31 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  36.27 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  34.43 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  38.03 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  36.07 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18500  D-alanine--D-alanine ligase  36.46 
 
 		 371 aa  219  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  36.24 
 
 		 368 aa  219  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>