More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0672 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0672  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 
377 aa  767    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00380934  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0264  D-alanyl-alanine synthetase A  54.26 
 
 
377 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  48.4 
 
 
378 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  40.38 
 
 
375 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  36.27 
 
 
367 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  36.68 
 
 
367 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  37.6 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  35.12 
 
 
364 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  35.41 
 
 
366 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  36.68 
 
 
362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  34.59 
 
 
366 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  33.78 
 
 
366 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  36.41 
 
 
361 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  36.41 
 
 
361 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 
364 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  36.41 
 
 
361 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  36.41 
 
 
361 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  36.14 
 
 
361 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  35.91 
 
 
375 aa  228  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 
364 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 
364 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 
364 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  36.93 
 
 
361 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  34.53 
 
 
364 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  36.96 
 
 
369 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  35.33 
 
 
362 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  37.2 
 
 
361 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  34.3 
 
 
370 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  34.88 
 
 
383 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  36.72 
 
 
355 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  37.9 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  34.49 
 
 
364 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  35.54 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  34.63 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  37.26 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  35.41 
 
 
353 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  35.41 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  37.47 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  38.18 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  37.19 
 
 
351 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  33.79 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  33.25 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  34.95 
 
 
365 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  35.44 
 
 
363 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  36.24 
 
 
355 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  33.51 
 
 
360 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  35.59 
 
 
355 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  35.14 
 
 
361 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  35.33 
 
 
360 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  35.11 
 
 
363 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  34.87 
 
 
322 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  34.78 
 
 
324 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  35.91 
 
 
352 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  35.9 
 
 
376 aa  203  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  34.89 
 
 
362 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  35.89 
 
 
355 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  37.18 
 
 
382 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  34.27 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  33.61 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  33.61 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  33.52 
 
 
348 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  32.97 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  33.69 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  32.57 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  32.29 
 
 
353 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  33.97 
 
 
363 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  35.1 
 
 
349 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  33.79 
 
 
360 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  35.52 
 
 
367 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  33.88 
 
 
376 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  31.91 
 
 
367 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  35.56 
 
 
351 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  32.1 
 
 
348 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  31.72 
 
 
384 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  31.76 
 
 
383 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  32.04 
 
 
365 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  34.08 
 
 
347 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  31.56 
 
 
377 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  29.41 
 
 
358 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  29.8 
 
 
357 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 
367 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  33.98 
 
 
369 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  31.47 
 
 
372 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4346  D-alanine--D-alanine ligase A  32.34 
 
 
352 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1521  D-alanine--D-alanine ligase  32.34 
 
 
352 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  29.95 
 
 
367 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  33.24 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3672  D-alanine--D-alanine ligase  32.34 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  33.06 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  32.87 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  32.29 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  32.44 
 
 
377 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>