More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1551 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 344 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  34.69 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  35.99 
 
 		 637 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  35.13 
 
 		 663 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  32.11 
 
 		 731 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  31.44 
 
 		 727 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  31.1 
 
 		 728 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  31.1 
 
 		 728 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  29.81 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  31.16 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  29.1 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  29.74 
 
 		 743 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  29.07 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  29.86 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  30.03 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  27.07 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  27.07 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  28.75 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  32.07 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  28.9 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  27.38 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  30.52 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  28.84 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  31.16 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  27.13 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  28.73 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  28.48 
 
 		 331 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  30.86 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  28.97 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  27.84 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.57 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  26.48 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  26.58 
 
 		 309 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  26.25 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  28.88 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  28 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  27.62 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  29.26 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  27.95 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  27.3 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  28.42 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  27.83 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  27.11 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  30.43 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  27.82 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  28.43 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  24.53 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  26.81 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  27.92 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  27.67 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  27.4 
 
 		 329 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  27.27 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  26.17 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  27.04 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  28.94 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  28.94 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 		 306 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  29.71 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  25.39 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  29.3 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  28.94 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  30 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  27.39 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  26.4 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  26.88 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  27.5 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  27.07 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  29.15 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  26.88 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  28.69 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  25.26 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  24.91 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  27.44 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  28.29 
 
 		 316 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  30.07 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  30.07 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.06 
 
 		 362 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  25.31 
 
 		 313 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  30.07 
 
 		 306 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  26.03 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  26.39 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  27.24 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  28.04 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  25.39 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  28.47 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  28.19 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  24.38 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  26.98 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3043  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.28 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  25.48 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  25.88 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>