More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1501 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  57.06 
 
 
343 aa  347  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  44.25 
 
 
354 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  38.97 
 
 
637 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  36.9 
 
 
663 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  26.59 
 
 
347 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  31.14 
 
 
728 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 
727 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 
728 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  26.82 
 
 
344 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.28 
 
 
339 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  31.87 
 
 
731 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  30.19 
 
 
336 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  24.28 
 
 
310 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  25.66 
 
 
743 aa  100  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  27.63 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  27.86 
 
 
338 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  27.44 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  28.99 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  31.13 
 
 
340 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  27.92 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  29.96 
 
 
308 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  28.08 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
527 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  24.71 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  28.04 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  30.16 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  29.64 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  28.63 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  26.18 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  29.07 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  28.02 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  27.01 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3043  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.4 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  27.91 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  26.64 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  27.95 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  29.12 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  29.02 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  29.12 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  28.57 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  28.57 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  25.97 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  27.38 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  27.76 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  27.57 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  27.36 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  27.24 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  27.53 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  30.27 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  27.64 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0730  hypothetical protein  26.39 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.33514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  27.52 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  24.53 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  28.75 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  26.85 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  25.66 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  26.71 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  25.19 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  28.52 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  28.4 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  28.35 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  26.17 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  25.1 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  24.53 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  27.46 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  25.43 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  25.39 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  25.39 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  28.29 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  25.39 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  23.77 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  23.77 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  28.29 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  28.06 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  26.98 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  28.97 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  24.83 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  26.02 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  28.12 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  24.15 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  26.07 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  23.83 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  26.07 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  28.16 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  27.56 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  26.07 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.330245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>