257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1724 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1724  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  698    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.92014  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1501  hypothetical protein  57.06 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  49.1 
 
 
354 aa  325  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  39.18 
 
 
637 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  39.42 
 
 
663 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1410  D-alanine--D-alanine ligase  32.79 
 
 
728 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.801372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1506  D-alanine--D-alanine ligase  32.79 
 
 
728 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.736453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1418  D-alanine--D-alanine ligase  32.69 
 
 
731 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2449  D-alanine--D-alanine ligase  32.14 
 
 
727 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1551  D-alanine--D-alanine ligase  29.18 
 
 
344 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0372534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0081  D-alanine--D-alanine ligase  26.77 
 
 
310 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.201322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0629  D-ala D-ala ligase  30.43 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  29.39 
 
 
743 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2749  D-alanine--D-alanine ligase  31.14 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_570  D-alanine--D-alanine ligase  31.13 
 
 
338 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  24.53 
 
 
347 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0135  D-alanine--D-alanine ligase  29.84 
 
 
336 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0602  D-alanine--D-alanine ligase  28.3 
 
 
338 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  26.04 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2162  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  25.52 
 
 
339 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3042  D-alanine--D-alanine ligase  28.24 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1775  D-alanine--D-alanine ligase domain protein  28.57 
 
 
331 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.286204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  27.59 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1774  protein of unknown function DUF201  28.8 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.119478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  25.28 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  25.28 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  27.62 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  25.51 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  27.11 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  24.91 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  25.3 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  25.3 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  25.84 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  25.84 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  24.16 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  24.54 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4256  D-alanine--D-alanine ligase  33.59 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.231762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  27.55 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  24.54 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  27.33 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  27 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  26.57 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2496  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.1 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  26.04 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  26.53 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  26.41 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  25.5 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0713  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  28.82 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323281  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  26.88 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  25.41 
 
 
303 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  26.77 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  27.18 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  25.87 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  24.69 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  26.55 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  26.1 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  26.96 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  26.18 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  25.79 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  26.46 
 
 
348 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  26 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  25.24 
 
 
298 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3043  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.14 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  26.46 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  25.99 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  25.3 
 
 
331 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  25.61 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  26.1 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  25.8 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  25.21 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  26.46 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  28.98 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  24.35 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  25.08 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  23.37 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  25.29 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0730  hypothetical protein  23.74 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.33514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  26.1 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  24.7 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  26.56 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  23.89 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  24.32 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1891  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
527 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  26.53 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  26.6 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  29.88 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  24.49 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  25.78 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  24.92 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  26.29 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  25.97 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  25.61 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  24.8 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  25.4 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>