More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2649 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  69.64 
 
 		 308 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  64.09 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  56.19 
 
 		 302 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  58.05 
 
 		 302 aa  332  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  45.45 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  42.9 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  38.6 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  45.82 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  43.28 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  42.81 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  42.76 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  41.55 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  40.2 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  40.51 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  41.09 
 
 		 346 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  36.36 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  40.46 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  40.79 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  42.62 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  35.18 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  38 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  38 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  38.38 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  37.12 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  37.67 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  37.67 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  37.67 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.02 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  40.14 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  36.79 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  39.09 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  43 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  43.1 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  40.4 
 
 		 308 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  40.88 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  36.98 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 312 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  42.33 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  42.42 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  40.68 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  40.68 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  39.49 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 		 332 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  41.5 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  36.78 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  42.09 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  39.39 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  40.8 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  40.53 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  40.53 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  39.14 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.91 
 
 		 306 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.91 
 
 		 306 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.64 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  40.84 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  44 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  40.68 
 
 		 627 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  37.05 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  39.14 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  38.44 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  38.78 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  39.26 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  34.77 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  37.84 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  38.8 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  41.39 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  38.78 
 
 		 324 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>