More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0260 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 305 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1078  D-alanine/D-alanine ligase  54.82 
 
 		 299 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  49.67 
 
 		 301 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  46.36 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  46.69 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  46.69 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  45.03 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  44.7 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  44.7 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  44.7 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  45.03 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  45.03 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  44.37 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  44.55 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  37.28 
 
 		 336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  37.83 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  35.18 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  38.02 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  36.58 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.66 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  38.76 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  38.76 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  34.64 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.93 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  35.95 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  36.49 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  37.17 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  35.45 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  34.44 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  36.88 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  34.64 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.17 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  36.15 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.17 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  36.84 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  36.84 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.73 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  35.53 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  33.78 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  35.48 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  35.2 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  33.55 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  35.58 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  35.58 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  35.74 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  36.45 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  34.88 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  33.33 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  31.82 
 
 		 367 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  33.55 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  30.57 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  34.38 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  31.73 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  35.29 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  35.08 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  36.84 
 
 		 627 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  31.85 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  31.85 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  34.31 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  34.33 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  33.87 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  34.64 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  33.44 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  36.82 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  34.87 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  35.76 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  36.01 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>