More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3455 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 336 aa  672    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  59.7 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  59.7 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  56.18 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  40.95 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.28 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  42.99 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  42.9 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  41.76 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  41.82 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  41.52 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  40.65 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  40.8 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  41.03 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  40.73 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  40.41 
 
 		 308 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  41 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  42.69 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  35.63 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  39.88 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  35.63 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  35.63 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  35.33 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  37.22 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  35.33 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  39.66 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  35.33 
 
 		 304 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  42.22 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  36.5 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  35.03 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  35.03 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  35.03 
 
 		 304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  36.5 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  37.28 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  41.21 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  35.14 
 
 		 311 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  41.82 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  34.95 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  34.48 
 
 		 376 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  40.98 
 
 		 627 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  38.21 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  36.31 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  40.36 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  38.58 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  38.79 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  40.91 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  38.58 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 364 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 364 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 364 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  40.43 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  35.2 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.78 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  40.65 
 
 		 331 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  40.83 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.65 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  35.51 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.65 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  38.02 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.04 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  40.24 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  36.47 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  38.01 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  40.23 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  37.54 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  39.01 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  40.18 
 
 		 311 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  38.92 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  32.84 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  39.17 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  38.41 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  38.08 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  40.3 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  36 
 
 		 383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  37.85 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 		 306 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  37.39 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 		 306 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  38.23 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>