More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2153 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 333 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  56.78 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  57.1 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  57.41 
 
 		 326 aa  322  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  54.11 
 
 		 326 aa  315  7e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  56.31 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  54.22 
 
 		 329 aa  312  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  53.63 
 
 		 329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  54.75 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  49.2 
 
 		 316 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  54.75 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  52.9 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  52.88 
 
 		 323 aa  299  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  50.64 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  52.22 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  51.32 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  53.87 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4215  D-alanine--D-alanine ligase  55.45 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  49.35 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  50.32 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  41.94 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  38.74 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.95 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  38.98 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  40 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  37.99 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  35.02 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  37.11 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 		 308 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  37.78 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  37.11 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  41.97 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  34.31 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  38.14 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  36.48 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  33.62 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  41.1 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  36.07 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  37.73 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  37.17 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  38.41 
 
 		 301 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  35.64 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  35.33 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  34.41 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  36.22 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  34.41 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  34.73 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 306 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  34.62 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  38.21 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.94 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  35.78 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  36.14 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.06 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  33.55 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  35.26 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0319  D-alanine--D-alanine ligase  36.36 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0126271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2753  D-alanine--D-alanine ligase  40.06 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  36.01 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  35.6 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0009  D-alanine/D-alanine ligase  34.73 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.542001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  35.85 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  35.08 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  35.71 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  31.8 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  42.01 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  35.02 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  36.3 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  35.2 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  35.99 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>