More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2524 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  94.74 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  95.07 
 
 		 304 aa  591  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  95.72 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  94.08 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  94.08 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  94.08 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  94.08 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  94.08 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  93.75 
 
 		 304 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  53.16 
 
 		 301 aa  340  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  52.49 
 
 		 301 aa  339  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  48.82 
 
 		 302 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  44.55 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1078  D-alanine/D-alanine ligase  44 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  41.21 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  37.3 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  38.78 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  38.85 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  35.14 
 
 		 336 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  39.14 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  36.58 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  36.69 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  37.37 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  37.14 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  39.3 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  36.36 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  37.04 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  37.7 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  39 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  38.41 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  40.97 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.21 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  35.92 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  37.1 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.26 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.87 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.21 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  35.81 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.29 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  35 
 
 		 346 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.61 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  36.88 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  34.92 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  35.63 
 
 		 346 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.29 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  35.06 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  38.18 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  35.2 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  37.95 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  36.09 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  37.95 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  36.09 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  35.55 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  36.54 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  36.89 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  36.93 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  35.55 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  35.29 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  33.99 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 		 359 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  35.95 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 627 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  36.3 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  35.58 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  32.83 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  35.18 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  37.29 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  34.34 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  36.66 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>