More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1078 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1078  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 299 aa  590  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  54.82 
 
 		 305 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  45.67 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  45.67 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  44.67 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  44 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  44 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  44 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  42.33 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  36.21 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  35.88 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  35.79 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  35.79 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  35.79 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  35.79 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  35.79 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  35.79 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  35.45 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  35.79 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  34.46 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  32.35 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  31.68 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  34.01 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  33 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  33 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  33 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  34.74 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  34.53 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  32.78 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  34.98 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  32.78 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  36.27 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  32.03 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  37.81 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  35.6 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  32.12 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  34.62 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  33 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  35.28 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  34.67 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  33.12 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  32.01 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  33 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  31.02 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  35.95 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  32.03 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  32.8 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  31.54 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  31.79 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  31.79 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  33 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  36.09 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  33.88 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  32.88 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  32.78 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  34.08 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  31.91 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  32.11 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  31.05 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  34.65 
 
 		 627 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  34.35 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  30.91 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  28.99 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  32.5 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  32.79 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  32.35 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  31.88 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  29.66 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  31.8 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  30.62 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  29.1 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  30 
 
 		 313 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  32.89 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>