More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0665 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  94.39 
 
 		 303 aa  577  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  49.21 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  46.03 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  40.4 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  42.76 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  41.94 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  40.59 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.42 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  38.83 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  38.83 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  40.39 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1208  D-alanine/D-alanine ligase  40.13 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  41.29 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  38.74 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  39.49 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  42.95 
 
 		 325 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  39.23 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.61 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  38.14 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  41.39 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  38.31 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  38.31 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  39.34 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.83 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  37.92 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  39.54 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  37.92 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  37.88 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  40.92 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  39.06 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  37.83 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  37.05 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  38.61 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  40.26 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  35.53 
 
 		 379 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  39.74 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  38.19 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  38.74 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  39.93 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  36.98 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  37.05 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  38.22 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  41.75 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  38.38 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>