More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1244 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 
316 aa  635    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  43.69 
 
 
305 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  42.12 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  42.77 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  43.55 
 
 
307 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  42.04 
 
 
305 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  45.07 
 
 
308 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  42.31 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  40.95 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  39.55 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  41.72 
 
 
305 aa  211  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  44.37 
 
 
309 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 
308 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  35.14 
 
 
311 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 
308 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  37.38 
 
 
299 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  41.88 
 
 
306 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  41.83 
 
 
310 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 
306 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 
306 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  42.21 
 
 
306 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 
306 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  40.33 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 
317 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  40.58 
 
 
317 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 
318 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  41.23 
 
 
318 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  41.85 
 
 
326 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  40.58 
 
 
306 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 
308 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 
306 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  39.74 
 
 
303 aa  198  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  41.45 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  39.09 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  39.24 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 
337 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 
304 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  36.74 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  40.26 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  40.58 
 
 
316 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 
312 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  39.55 
 
 
327 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 
304 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 
334 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  34.86 
 
 
340 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 
304 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 
304 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 
304 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 
304 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.12 
 
 
316 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  36.25 
 
 
304 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  41.99 
 
 
308 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 
329 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  34.5 
 
 
316 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  40.06 
 
 
315 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  36.25 
 
 
304 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  40.92 
 
 
301 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  38.91 
 
 
332 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  38.91 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 
342 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 
308 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  38.91 
 
 
317 aa  189  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  36.66 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  41.97 
 
 
333 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  39.33 
 
 
306 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 
331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  37.99 
 
 
322 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 
323 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  40.82 
 
 
310 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 
320 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 
331 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 
306 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  38.98 
 
 
327 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  40.06 
 
 
313 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  40.52 
 
 
306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  37.68 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  39.56 
 
 
627 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  41.35 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  38.19 
 
 
306 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  41 
 
 
314 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 
320 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  42.26 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 
316 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 
320 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.86 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.86 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 
323 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 
306 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 
346 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 
302 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.91 
 
 
306 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>