More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1796 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 312 aa  631  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  60.38 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  57.74 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  54.63 
 
 		 306 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  52.26 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  49.2 
 
 		 311 aa  315  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  49.83 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  48.4 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  46.25 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  45.51 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  45.57 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  44.84 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  42.54 
 
 		 313 aa  255  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  43.04 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  43.04 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  44.92 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  42.27 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  44.12 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  44.05 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  42.63 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  46.23 
 
 		 627 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  43.42 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  44.34 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  44.74 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  43.46 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  43.97 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  42.53 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  42.76 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  41.94 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  45.25 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  44.3 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  43.93 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  43.29 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  41.56 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  41.75 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  42.43 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  43.61 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  39.94 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 306 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  43.97 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  40.97 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  40.97 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  44.67 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 306 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  42.77 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  44.33 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  42.81 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  40.84 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  42.9 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  42.9 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  40.65 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  42.67 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  39.71 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  42.39 
 
 		 331 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  37.74 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  37.3 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  40.26 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  42.67 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  37.3 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  42.02 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  39.1 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  43.33 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  40.32 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  40.32 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  40.32 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  37.1 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  38.66 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  39.66 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  41.51 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  42.49 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>