More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0816 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  58.25 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  58.59 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  49.33 
 
 		 304 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  48.99 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  49.16 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  49.16 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  48.82 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  48.82 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  48.82 
 
 		 304 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  48.82 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  48.48 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  48.48 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  46.36 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  39.94 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1078  D-alanine/D-alanine ligase  42.33 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  36.52 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.91 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  34.34 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  34.95 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  36.05 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.62 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  36.16 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  38.31 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  35.03 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  36.13 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  33.67 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  34.3 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  37.75 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  34.43 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  32.84 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  34.03 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  35.71 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  33.73 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  38.44 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  33.11 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  35.24 
 
 		 367 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 		 338 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 342 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  36.12 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  32.67 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  32.89 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  36.03 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  33.88 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  36.84 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  34.44 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  35.08 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  34.44 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  32.67 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  33.56 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  31.41 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  34.24 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  32.67 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  33.88 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  36.79 
 
 		 627 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  34.3 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  31.09 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  36.12 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  34.41 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  35.92 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  33.43 
 
 		 360 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  33.81 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  33.99 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  35 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  31.09 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  34.22 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  32.7 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  32.46 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  32.46 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  35.07 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  33.56 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  35.64 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  34.65 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  34.31 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  34.08 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>