More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1074 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  56.19 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  53.82 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  55.52 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  51.16 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  47.25 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  44.77 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  38.55 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  41.32 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  41.32 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  38.99 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  36.54 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  40.13 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  38 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  37.42 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  32.67 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  40.13 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  38.25 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  38.13 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  36.63 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  37.04 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  36.36 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  39.06 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.64 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.05 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  36.72 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  38.26 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  36.72 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.1 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  37 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  38.49 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  38.23 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  38.49 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.05 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  36.39 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  36.39 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  37.05 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  37.87 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  36.13 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1749  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2671  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  35.91 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  36.18 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  35.97 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  38.26 
 
 		 329 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  36.62 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  35.16 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  38.02 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  36.75 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  34.64 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  33.44 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  36.6 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  36.09 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  35.05 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  36.82 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>