More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0366 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  69.64 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  60.98 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  59.06 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  55.52 
 
 		 302 aa  315  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  46.1 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  42.22 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  44.44 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  43.34 
 
 		 305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  42.81 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  40.18 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  37.72 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  34.78 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.41 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  41.09 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 		 317 aa  199  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  41.69 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  39.23 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  41.84 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  39.8 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  41.5 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  39.73 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  39.39 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  40.73 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  38.78 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  35.18 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  41.53 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 		 627 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  40.41 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  35.2 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  39.2 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  38.64 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  40.82 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  36.91 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  36.91 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  35.9 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  40.97 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  37.67 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  38.51 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  36.36 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  38.98 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  40.27 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  41 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  38.38 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  34.98 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  37.12 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  35.1 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  39.06 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  39.06 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  37.58 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  34.19 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  36.63 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  35.64 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2842  D-alanine--D-alanine ligase  40.2 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 307 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  38.33 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  36.03 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  36.96 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  36.67 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  35.03 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  33.99 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  34.23 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  36.34 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  35.92 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  37.26 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  38.74 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>