More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6870 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 342 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  60.24 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  60.24 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  56.18 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  38.55 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  40.85 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  42.81 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  39.76 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  41.62 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  38.99 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  39.75 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  39.58 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  39.44 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  38.74 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  37.61 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  39.08 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  38.97 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  39.08 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  35.69 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  37.92 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  39.7 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  39.76 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.05 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  38.15 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  38.25 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  39.64 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  38.15 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  37.76 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  35.76 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  39.7 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  35.45 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  40.18 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  38.39 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  38.48 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  40.06 
 
 		 332 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  38.48 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  39.1 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  38.58 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  37.77 
 
 		 313 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  40.66 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  39.76 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  38.39 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  37.32 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  39.27 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  38.1 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  36.12 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  38.48 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  38.05 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.6 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  40.3 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  37 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  38.86 
 
 		 627 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  39.63 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  36.98 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  38.95 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.39 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  33.43 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.43 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  37.24 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  35.54 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  33.43 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  33.74 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  33.74 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  33.43 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  37.99 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.43 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.43 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.43 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.09 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  37.24 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  36.52 
 
 		 338 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.09 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  38.77 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  36.16 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  38.97 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  33.43 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  33.13 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  38.19 
 
 		 315 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  33.13 
 
 		 304 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  35.49 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  32.83 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  37.08 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  37.07 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  31.74 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  38.58 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>