More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9048 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 315 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  62.9 
 
 		 316 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  65.48 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  63.87 
 
 		 326 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  57.61 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  60 
 
 		 323 aa  348  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  62.22 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  58.92 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  60.19 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  58.06 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  60 
 
 		 349 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  58.58 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4215  D-alanine--D-alanine ligase  58.61 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  57.47 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  54.63 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  53.72 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  53.33 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  54.31 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  53.25 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  52.9 
 
 		 333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.12 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  41.1 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  41.07 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  34.5 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  39.55 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  35.13 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  40.71 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  40.84 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.95 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  37.97 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  40.13 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  38.08 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  37.3 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.13 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03490  ATP-grasp enzyme, D-alanine-D-alanine ligase  36.22 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  39.31 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  38.19 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.13 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  37.7 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 312 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  38.91 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  38.34 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  38.29 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  39.34 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  38.14 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  37.02 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  36.94 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  36.91 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  39.23 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  36.77 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  36.28 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  34.1 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  36.36 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.93 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  35.48 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  35.99 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  39.67 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  33.62 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  35.96 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0488  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0391876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  35.28 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  36.25 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  32.2 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  38.19 
 
 		 627 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>