More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0360 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 330 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  46.67 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  46.33 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  45.36 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  46.77 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  46 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  45.45 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  45.33 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  45.33 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  45.39 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  45.97 
 
 		 310 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  43.81 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  43.93 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  46.31 
 
 		 627 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  42.43 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  43.09 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  42.43 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  42.43 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  43.71 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 306 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  43.32 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  43.09 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  42.71 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  42.62 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  41.78 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  41.78 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  42.37 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  44.16 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  40.91 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  40.91 
 
 		 309 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  43.19 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  41.45 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  42.01 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  40.79 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  43.05 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  42.95 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  43.77 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  42.03 
 
 		 318 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  42.19 
 
 		 310 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 332 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  42.37 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  43.48 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  35.45 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  42.62 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  41.2 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2198  D-alanine/D-alanine ligase  42.76 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0703567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  42.05 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1967  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000254256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  42.19 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  36.89 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  39.52 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  35.48 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 305 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  38.77 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  40.72 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  41.25 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  38.74 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  41.12 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  44.34 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  41.95 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  41.95 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  41.46 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  39.39 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1749  D-alanine--D-alanine ligase  39.06 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  41.78 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  38.08 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  40.98 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  39.13 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  41.39 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  41.37 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  41.58 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  33.98 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  37.17 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  40.71 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  37.17 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  43.05 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>