More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4160 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 333 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  51.9 
 
 		 316 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  53.14 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  48.86 
 
 		 313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  51.97 
 
 		 627 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  48.36 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  49.17 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  50.33 
 
 		 308 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  48.84 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  48.85 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  48.18 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  49.17 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  49.19 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  46.82 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  43.42 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  41.58 
 
 		 311 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  43.81 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  42.71 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  42.43 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  41.84 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  42.67 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  41.33 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  42.18 
 
 		 318 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  42.18 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  42.18 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  41.84 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  41.39 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  42.18 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  39.73 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  39.2 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  39.2 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  41.5 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  41.06 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  40.4 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  40.73 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  40.73 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  39.2 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  40.73 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  42.28 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  42.62 
 
 		 319 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  41.37 
 
 		 308 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  42.62 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  40.59 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  39.2 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  41 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  40.47 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  40.4 
 
 		 306 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  42.63 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  41.58 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  42.31 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  41.99 
 
 		 307 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  42.71 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  40.33 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  39.67 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  37 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  39.67 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2426  D-alanine--D-alanine ligase  39.73 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  41.69 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  40.71 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  42.37 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  39.8 
 
 		 310 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  38.66 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  38.02 
 
 		 308 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  33.67 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  39.05 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  39.8 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  39.46 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>