More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0095 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 315 aa  638    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  44.85 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  45.7 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  46.36 
 
 		 307 aa  265  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  44.22 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  46.03 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  43.05 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  45.7 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  44.52 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  41.72 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  43.33 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  42.95 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  42.53 
 
 		 312 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  44.86 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  44.71 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  43.52 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  42.95 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  44.41 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  42.19 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0944  D-alanine--D-alanine ligase  46.49 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000259534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  44.82 
 
 		 627 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  45.08 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  43.69 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  44.71 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2406  D-alanine--D-alanine ligase  45 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  45.33 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2419  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000977775  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  40.6 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  41.53 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  42.71 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  42.52 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  40.8 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  40.8 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  40.13 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  41.22 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  39.26 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.73 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  38.93 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2753  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  40.78 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1385  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1428  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.92 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  41.33 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  39.2 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.37 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  35.22 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  39.38 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  40.82 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  35.22 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  35.22 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  35.88 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  37.13 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  33.12 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  37.79 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  36.21 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  34.22 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  34.82 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  36.19 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  35.37 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  33 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  35.1 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  37.41 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  35.97 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  32.74 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  34.46 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  35.28 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  34.74 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  34.74 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  34.74 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  34.74 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  34.74 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  34.74 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  35.53 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>