More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0944 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0944  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 306 aa  634    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000259534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  68.93 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  65.37 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  63.11 
 
 		 308 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  64.72 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  63.11 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1385  D-alanine--D-alanine ligase  67.96 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1428  D-alanine--D-alanine ligase  67.96 
 
 		 308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  62.13 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  58.82 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  59.15 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  58.17 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  57.19 
 
 		 307 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  54.9 
 
 		 307 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  56.86 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  56.21 
 
 		 307 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  53.92 
 
 		 308 aa  346  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  55.23 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0325  D-alanine--D-alanine ligase  56.86 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0370314  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2406  D-alanine--D-alanine ligase  60.13 
 
 		 301 aa  318  7.999999999999999e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  59.14 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  51.15 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  52.12 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  52.12 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  49.34 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  51.47 
 
 		 307 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2419  D-alanine--D-alanine ligase  50.49 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000977775  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  48.86 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2753  D-alanine--D-alanine ligase  46.95 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  45.81 
 
 		 322 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  51.47 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  46.36 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  45.69 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  45.36 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  46.49 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  44.7 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  46.38 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  45.25 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  47.19 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  44.97 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  45.75 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  44.77 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  44.77 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  43.96 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  43.75 
 
 		 627 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  43.04 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  43.32 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  42.77 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  41.23 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 314 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  42.44 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  41.35 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  44.12 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  40.19 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  41.5 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  40.95 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  40.51 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  40.39 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  39.87 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  39.87 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  39.27 
 
 		 333 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  40.2 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  35.33 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  39.67 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  36.63 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  39.23 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  39.14 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  39.14 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  37.74 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  38.41 
 
 		 337 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  40.57 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  37.82 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  39.09 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  39.13 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  38.96 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  36.75 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  37.1 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  38.33 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2030  D-alanine--D-alanine ligase  36.95 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.24983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  36.91 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  39.14 
 
 		 318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  39.14 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1749  D-alanine--D-alanine ligase  37.89 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>