More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3887 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  79.87 
 
 
308 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  80.19 
 
 
308 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  81.17 
 
 
308 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  55.81 
 
 
310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  53.82 
 
 
305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  53.82 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  53.49 
 
 
305 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  51.99 
 
 
313 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  50.32 
 
 
310 aa  291  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  52.32 
 
 
627 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  48.85 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  48.84 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  45.67 
 
 
330 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  42.63 
 
 
314 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  45.54 
 
 
317 aa  248  8e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  44.74 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  50 
 
 
311 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  44.82 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  44.63 
 
 
307 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 
306 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  44.56 
 
 
318 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  44.22 
 
 
318 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  46.62 
 
 
319 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  46.96 
 
 
319 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 
306 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  44.67 
 
 
306 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  43.52 
 
 
308 aa  235  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  43.54 
 
 
318 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  44.26 
 
 
318 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  45.67 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  42.99 
 
 
336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  43.83 
 
 
310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  45.15 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  46.23 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  44.26 
 
 
309 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  43.2 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  43.29 
 
 
317 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 
313 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 
323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 
315 aa  229  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  46.75 
 
 
307 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  47.51 
 
 
301 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  42.76 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  42.76 
 
 
306 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  46.77 
 
 
307 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  47.39 
 
 
307 aa  228  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 
306 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 
306 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  45.1 
 
 
308 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0686  D-alanine--D-alanine ligase  45.93 
 
 
306 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  decreased coverage  0.000224556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  43.67 
 
 
306 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  43.09 
 
 
306 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  42.76 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  42.76 
 
 
306 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  43.52 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  42.76 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  42.76 
 
 
306 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  40.54 
 
 
313 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  42.11 
 
 
306 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  36.74 
 
 
311 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2419  D-alanine--D-alanine ligase  46.69 
 
 
308 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000977775  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  44.55 
 
 
308 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  37.12 
 
 
299 aa  225  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  46.43 
 
 
307 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  44.15 
 
 
313 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  46.75 
 
 
307 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  44.3 
 
 
315 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  41.67 
 
 
306 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  45.78 
 
 
307 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  41.28 
 
 
308 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  42.95 
 
 
306 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  46.98 
 
 
302 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  44.92 
 
 
304 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  44.69 
 
 
308 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  42.16 
 
 
332 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2753  D-alanine--D-alanine ligase  45.57 
 
 
316 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  41.33 
 
 
306 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  42.16 
 
 
332 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  41.33 
 
 
306 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  41.33 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0697  D-alanine--D-alanine ligase  45.16 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.389866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  46.49 
 
 
318 aa  222  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  43.1 
 
 
324 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  46.73 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  45.28 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  48.85 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  43.29 
 
 
346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  43.29 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  42.21 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  43.46 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 
308 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  43.88 
 
 
314 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  44.95 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2111  D-alanine--D-alanine ligase  45.39 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0787  D-alanine--D-alanine ligase  45.39 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  0.289278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  44.82 
 
 
320 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  42.53 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  42.47 
 
 
319 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  43.85 
 
 
300 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>