More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1588 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 316 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  49.68 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  49.21 
 
 		 303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  40.69 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.29 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.62 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  38.24 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  38.94 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  40.95 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  38.7 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  38.54 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  39.81 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  36.36 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.41 
 
 		 314 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  38.59 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  38.82 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.03 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.03 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.03 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  38.73 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 304 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  38.92 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  36.71 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  38.68 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  36.71 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 627 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  38.29 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  38.29 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  38.41 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  36.34 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  36.28 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  38.73 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  37.07 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  36.02 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  36.02 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  35.13 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.61 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  32.39 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  35.74 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  35.14 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  38.41 
 
 		 305 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  34.82 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  34.95 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  37.82 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  35.76 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  39.3 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  40.82 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  33.65 
 
 		 329 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  36.22 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  35.13 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  37.38 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  34.5 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  34.29 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  35.35 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  35.05 
 
 		 306 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  35.05 
 
 		 306 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  35.05 
 
 		 306 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  35.9 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  35.26 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  35.26 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.01 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  34.82 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  34.17 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  34.08 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  35.49 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  37.03 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  34.7 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  35.86 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  35.9 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  35.58 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  36.94 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  35.02 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  34.81 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  32.38 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>