More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4102 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  57.1 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  49.35 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  47.87 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  48.4 
 
 		 312 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  46.01 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  46.45 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  47.37 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  46.43 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  47 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  46.79 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  46.82 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  46.47 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  46.93 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  44.23 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  49.51 
 
 		 627 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  47.49 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1074  D-alanine/D-alanine ligase  44.77 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.254672  normal  0.307992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  43.28 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  45.08 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  42.05 
 
 		 305 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  43.59 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  45.67 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  44.94 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  41.76 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  43.73 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  42.77 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  42.73 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  42.15 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  42.63 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  44.19 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  44.19 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  43.52 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  44.66 
 
 		 306 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  43.19 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  43.87 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  44.74 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  42.21 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  43.87 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  38.78 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  43.87 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  43.28 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 306 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  39.16 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  42.02 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  42.67 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 		 308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  43.18 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  43.85 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  43.23 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  44.12 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  43.58 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0872  D-alanine/D-alanine ligase  40.38 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  41.67 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  43.79 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  41.04 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  43.51 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  43.79 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  42.17 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  42.91 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  40.97 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  43.92 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  37.57 
 
 		 376 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  38.53 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3167  D-alanine--D-alanine ligase  42.27 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  43.92 
 
 		 319 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  43.58 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  43.24 
 
 		 318 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  42.26 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  36.65 
 
 		 367 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  37.68 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6870  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  42.49 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  37.64 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  41.56 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  43.05 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  38.15 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  42.37 
 
 		 376 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  44.15 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  42.71 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>