More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1643 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  40.4 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  40.4 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  40.69 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  40.27 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  37.67 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  32.47 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  32.57 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.74 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  31.72 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  34.88 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  33 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  33.89 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  30.9 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  32.79 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  32.89 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  31.91 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  32.89 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  32.89 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  32.56 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  33.22 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1208  D-alanine/D-alanine ligase  34.92 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  32.57 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  32.23 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  32.23 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0095  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.798262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  33.11 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  31.35 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  32.23 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  29.51 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  32.23 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  31.82 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  29 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  28.67 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  31.56 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 627 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  29.33 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  32.03 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  29.84 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  29.21 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  27.56 
 
 		 319 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  30.32 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  30.46 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  31.35 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  25.81 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  30.67 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  29.53 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  28.52 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  31.65 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  29.22 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  28.43 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  30.31 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  26.71 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  30.13 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  30.13 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  29.47 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  30.13 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  33.55 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  31.46 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  27.27 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  30.55 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  24.6 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  30.52 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03490  ATP-grasp enzyme, D-alanine-D-alanine ligase  28.05 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2988  D-alanine--D-alanine ligase  26.22 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  28.57 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  28.15 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  26.91 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  31.37 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  31.37 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  31.15 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  31 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  28.05 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  25.72 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  27.76 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  29.62 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  28 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  24.05 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  26.86 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  26.37 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  29.87 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  28.8 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  25.88 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  27.44 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  29.74 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  31.25 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  30.16 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2190  D-alanine--D-alanine ligase  30.59 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  28.48 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  30.16 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>