More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07996 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  100 
 
 		 324 aa  665    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  61.92 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  54.94 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  40.85 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  39.69 
 
 		 330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  37.77 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  34.44 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  33.96 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  35.37 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  33.52 
 
 		 359 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  33.54 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  32.72 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  32.71 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  31.4 
 
 		 376 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  33.64 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  31.87 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  31.5 
 
 		 319 aa  169  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  32.53 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  31.56 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  31.52 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  31.25 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  33.03 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  31.34 
 
 		 364 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  32.4 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  30.06 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  30.97 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  31.25 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  32.71 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  30.5 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  31.74 
 
 		 360 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  32.42 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  32.95 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  35.89 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  31.91 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  32.09 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  30.25 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  30.96 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  30.89 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  30.41 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  29.88 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  31.1 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  32.01 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  32.82 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  31.31 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  27.65 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  29.41 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  27.65 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  27.65 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  31.27 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  32.6 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  31.61 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  31 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  30.4 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  30.4 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  31 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  31 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  30.4 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  31 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  31.78 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  30.58 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  28.74 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  29.01 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  29.63 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  30.79 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  29.41 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  31.17 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  29.91 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  30.19 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  31.44 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  30.98 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  30.09 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  31.16 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  31.4 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  31.29 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  32.17 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  30.65 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  31.61 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  30.54 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  29.06 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>