More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4976 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  69.38 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  70.03 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  65.05 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  62.87 
 
 		 323 aa  362  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  63.16 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  59.67 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  59.67 
 
 		 329 aa  345  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  60.19 
 
 		 315 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  61.36 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  60.39 
 
 		 326 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  62.5 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  59.41 
 
 		 317 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  59.8 
 
 		 321 aa  325  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  56.58 
 
 		 317 aa  325  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  59.74 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  59.74 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4215  D-alanine--D-alanine ligase  62.54 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  56.31 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  54.61 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.12 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  40.63 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  40.8 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  42.86 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  38.8 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.85 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0319  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0126271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  41.61 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  40.46 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  41.18 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  40.72 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  41.36 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  34.82 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03490  ATP-grasp enzyme, D-alanine-D-alanine ligase  38.58 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  36.88 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  38.49 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  41.14 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  40.68 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.19 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  40.53 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  38.64 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  36.67 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  39.22 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.51 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  37.34 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  39.07 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  40.92 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0490  D-alanine--D-alanine ligase  38.39 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0465  D-alanine--D-alanine ligase  38.39 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  39.24 
 
 		 627 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  35.86 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  40.34 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  36.66 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  37.66 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  38.13 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  38.13 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  39.34 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  38.13 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3468  D-alanine--D-alanine ligase  38.03 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00570253  hitchhiker  0.00196625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  41.2 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  36.39 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0488  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0391876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  40.34 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  37.06 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2671  D-alanine--D-alanine ligase  36.68 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  36.67 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  39.22 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2834  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00118098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0079  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.704637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0561  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0620941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.09 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  37.99 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 318 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0532  D-alanine--D-alanine ligase  39.35 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000500002  normal  0.541798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  40.51 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2046  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000802497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  38.49 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  37.67 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  35.1 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  36.62 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  35.69 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2753  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  38.61 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>