More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5946 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 329 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  53.52 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  44 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  44.04 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  41.95 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07996  D-alanylalanine synthetase  40.85 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  35.61 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  34.08 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  34.81 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  34.1 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  35.98 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  34.06 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  34.94 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  34.16 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  37.81 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  31.59 
 
 		 376 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  35.19 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 317 aa  182  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  33.74 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  33.01 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  32.39 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  32.66 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  34.52 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  31.52 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  37.74 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  30.58 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  32.93 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 627 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  30.86 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  33.53 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  30.4 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  33.14 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  32.96 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  31.39 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  36.89 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  31.96 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  36.48 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  34.43 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  32.57 
 
 		 351 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  32.96 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  32.71 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  31.79 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  28.45 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  32.62 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  31.23 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.57 
 
 		 351 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  31.56 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  31.58 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  31.82 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  32.55 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  30.16 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  36.07 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  33.64 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  31.22 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  33.62 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  34.58 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  29.01 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  31.82 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  30.26 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  32.4 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  32.52 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  31.14 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  32.46 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  34.43 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  32.52 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  32.43 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  32.7 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  30.82 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  30.51 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  29.09 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  31.67 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  32.38 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  32.06 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  30.66 
 
 		 355 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  32.63 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  31.44 
 
 		 366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  28.25 
 
 		 361 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  29.91 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  28.96 
 
 		 383 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  31.43 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  31.16 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  32.41 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  31.68 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  30.84 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  31.75 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  30.37 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  32.32 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  32.06 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  30.9 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  30.9 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  31.07 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  31.59 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  32.25 
 
 		 308 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  33.6 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  32.32 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  30.46 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  31.1 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  32.32 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  30.68 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>