More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4917 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  44.85 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  41.64 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  39.87 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  38.54 
 
 		 312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  42.67 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  39.4 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  41.04 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  40.86 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  37.86 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  39.03 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  41.14 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  39.93 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  42.26 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  38.83 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  39.67 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  41.97 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  41.97 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  39.07 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  38.83 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2612  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000431315  unclonable  0.00000000000418412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  31.68 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 306 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  38.8 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  40.39 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.58 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  37.66 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.2 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.58 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  38.28 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  39.67 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  37.22 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  33.88 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 337 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  36.69 
 
 		 316 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  33.55 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  36.21 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  35.5 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  36.93 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  38.69 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  37.06 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  38.24 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  39.47 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  37.91 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0319  D-alanine--D-alanine ligase  37.35 
 
 		 333 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0126271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  41.12 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  39.87 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  36.57 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3087  D-alanine--D-alanine ligase  36.81 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  38.64 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  37.83 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  35.86 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  36.12 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2722  D-alanine--D-alanine ligase  37.01 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  38.36 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  38.11 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  35.83 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  37.58 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  38.56 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  31.25 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  37.21 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  35.86 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  36.93 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  36.48 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  39.02 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>