More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6426 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 
317 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  64.54 
 
 
326 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  64.04 
 
 
327 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  58.73 
 
 
316 aa  360  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  57.78 
 
 
318 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  55.23 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  52.24 
 
 
316 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  56.58 
 
 
319 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  53.33 
 
 
315 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  54.19 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  54.69 
 
 
314 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  51.94 
 
 
315 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  53.99 
 
 
317 aa  298  9e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  51.94 
 
 
329 aa  292  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  55.16 
 
 
349 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  52.22 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  53.97 
 
 
321 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  48.42 
 
 
319 aa  279  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  51.94 
 
 
326 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4215  D-alanine--D-alanine ligase  52.29 
 
 
313 aa  268  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  40.45 
 
 
318 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  41.35 
 
 
308 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  37.78 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  33.87 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  36.77 
 
 
306 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  37.86 
 
 
309 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 
317 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  36.66 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  35.48 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0319  D-alanine--D-alanine ligase  35.12 
 
 
333 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0126271  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  33.54 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  34.1 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  35.22 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0122  D-alanine--D-alanine ligase  37.26 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000652321  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  36.86 
 
 
309 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  38 
 
 
314 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  33.76 
 
 
312 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  35.5 
 
 
306 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  35.58 
 
 
324 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  36.77 
 
 
317 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  35.67 
 
 
305 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03490  ATP-grasp enzyme, D-alanine-D-alanine ligase  35.56 
 
 
327 aa  176  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.160227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  35.69 
 
 
319 aa  176  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  30.23 
 
 
299 aa  176  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  37.62 
 
 
306 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  33.77 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  35.16 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  35.16 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  35.16 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  35.16 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.26 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2858  D-alanine--D-alanine ligase  34.52 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000136858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  35.16 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  35.48 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  36.84 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  35.16 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  34.84 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  37.42 
 
 
326 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  37.18 
 
 
308 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  34.41 
 
 
306 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 
306 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  34.71 
 
 
303 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 
306 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  34.53 
 
 
306 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  34.85 
 
 
306 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  35.87 
 
 
316 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  32.17 
 
 
304 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  37.3 
 
 
308 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  35.35 
 
 
310 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  34.2 
 
 
306 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  37.3 
 
 
308 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 
308 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  37.82 
 
 
316 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  31.85 
 
 
304 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  36.33 
 
 
306 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2524  D-alanine--D-alanine ligase  31.86 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  36.3 
 
 
305 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0169  D-alanine--D-alanine ligase  33.96 
 
 
337 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0009  D-alanine/D-alanine ligase  35.28 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.542001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2450  D-alanine--D-alanine ligase  37.46 
 
 
325 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0817571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  37.06 
 
 
302 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03256  D-alanine--D-alanine ligase  34.09 
 
 
322 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  36.31 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  33.97 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  32.27 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  36.6 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  36.45 
 
 
314 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0526  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 
332 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000337974  hitchhiker  0.0000125004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  34.29 
 
 
336 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  35.92 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  36.74 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  35.97 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>