More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2988 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2988  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 328 aa  650    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03490  ATP-grasp enzyme, D-alanine-D-alanine ligase  60.55 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0319  D-alanine--D-alanine ligase  47.53 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0126271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5088  D-alanine--D-alanine ligase  38.72 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3582  D-alanine/D-alanine ligase  37.2 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4691  D-alanine--D-alanine ligase  37.8 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7091  D-alanine--D-alanine ligase  38.89 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39720  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9380  D-alanine--D-alanine ligase  35.58 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3371  D-alanine/D-alanine ligase  38.3 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0642922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4976  D-alanine/D-alanine ligase  36.89 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2236  D-alanine--D-alanine ligase  36.28 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0429667  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6711  D-alanine--D-alanine ligase  36 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4584  D-alanine--D-alanine ligase  36.28 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.984407  hitchhiker  0.000547053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9048  D-alanine/D-alanine ligase  37.61 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.499515  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  37.34 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2550  D-alanine--D-alanine ligase  36.31 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352521  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4215  D-alanine--D-alanine ligase  39.74 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6426  D-alanine/D-alanine ligase  34.25 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5406  D-alanine--D-alanine ligase  33.74 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1640  D-alanine--D-alanine ligase  34.56 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  35.91 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5102  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.842129  unclonable  0.0000000223224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0952  D-alanine/D-alanine ligase  28.44 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  33.13 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  32.82 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  32.93 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37970  D-alanine--D-alanine ligase  34.46 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  34.88 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  34.25 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2153  D-alanine--D-alanine ligase  31.71 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3423  D-alanine--D-alanine ligase  33.33 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1077  D-alanine--D-alanine ligase  32.62 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0742794  normal  0.822876 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  31.35 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  31.33 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  30.61 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  31.8 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  31.03 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  27.78 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  29.7 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  27.84 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  34.47 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  34.47 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1643  D-alanine--D-alanine ligase  26.22 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  29.57 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  34.38 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  31.93 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0464  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0823  D-alanine--D-alanine ligase  34.6 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3668  D-alanine--D-alanine ligase  32.91 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  32.13 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2978  D-alanine--D-alanine ligase  32.91 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00577366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2977  D-alanine--D-alanine ligase  33.44 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3126  D-alanine--D-alanine ligase  33.23 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  32.12 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  32.12 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  32.12 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  32.83 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  31.27 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0183  D-alanine--D-alanine ligase  30.67 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000736036  normal  0.566039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  32.43 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  32 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  32.31 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3415  D-alanine--D-alanine ligase  32.92 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0675936  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0921  D-alanine--D-alanine ligase  35.02 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14120  D-alanine--D-alanine ligase  33.03 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1426  D-alanine--D-alanine ligase  34.55 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  32.92 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  31.79 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0009  D-alanine/D-alanine ligase  32.52 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.542001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  31.79 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  33.33 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  31.16 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  34.19 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  32.58 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  32.51 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1472  D-alanine--D-alanine ligase  31.66 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  31.6 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  30.96 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0524  D-alanine--D-alanine ligase  34.38 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.860729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  31.69 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  34 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4463  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.816615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  32.49 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  32.49 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  32.06 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  32.93 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  32.49 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  32.49 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  30.84 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  32.49 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  32.49 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  31.27 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  32.81 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  32.28 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  32.18 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  29.97 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  32.06 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>